真空系統是凍干機的重要組成部分之一，一般包括旋片式真空泵或干泵和羅茨泵加速抽真空。

真空系統通過不銹鋼管路與冷凝器連接，在靠近冷凝器的位置處安裝有氣動蝶閥，將冷凝器與真空系統隔開。

真空系統的作用是建立真空，給冰的升華制造環境和條件。真空系統的真空度的高低直接影響制品的升華速率，真空系統要求其自身具有較低的泄漏率。真空控制的精度直接影響到制藥工藝的運行。

干泵控制工藝（普諾克真空科技）：

后箱制冷階段：干泵先預熱 15分鐘，同時開啟真空泵氮氣保護閥、開啟真空管路吹掃閥，開啟真空泵組冷卻水閥（GV80），預熱時間到關閉真空泵氮氣保護閥、關閉真空管路吹掃閥,再開啟小蝶閥。

干泵啟動：判斷后箱溫度低于-45度、設定后箱保溫時間到、干泵預熱15分鐘，打開小蝶閥開始預抽真空。預熱時間到，關閉真空泵氮氣保護閥，關閉真空管路吹掃閥。

復壓壓塞階段：小蝶閥關閉，真空泵開啟狀態下，進氣總閥干燥空氣供給閥可以開啟。

干泵停止：

①關閉小蝶閥，真空泵關指令，判斷小蝶閥關信號到位，開啟真空泵氮氣保護閥，開啟真空管路吹掃閥（真空管路吹掃閥是否設備自帶），以真空泵關指令為計時起點15min泵后關泵關閥。

②小蝶閥未關閉，真空泵關指令，立即關閉小蝶閥，干泵停止， 然后，關閉小蝶閥，真空泵關指令，判斷小蝶閥關信號到位，開啟真空泵氮氣保護閥，開啟真空管路吹掃閥（真空管路吹掃閥是否設備自帶），以真空泵關指令為計時起點15min泵后關泵關閥。

③冷凍自動運行過程中，停電再來電時，立即開啟真空泵。真空管路吹掃閥，掉電保持。冷凍自動斷電再來電，彈出對話框是否預熱，YES 預熱15分，NO直接開啟。

自動過程中：判斷自動啟動標志位，選擇備份或手動停掉一組，氮氣不吹掃不延時啟動停止。備份時直接停掉干泵，再次開啟直接開啟干泵。另外一臺干泵關掉，延時開啟10S是開啟第二臺干泵，2臺干泵N 一起吹掃。