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發(fā)酵培養(yǎng)基設(shè)計(jì)步驟
閱讀:370 發(fā)布時(shí)間:2022-11-17發(fā)酵培養(yǎng)基設(shè)計(jì)步驟
目前還不能從生化反應(yīng)的基本原理來推斷和計(jì)算出適合某菌種的培養(yǎng)基配方,只能用生物化學(xué)、細(xì)胞生物學(xué)、微生物學(xué)等的基本理論,參照前人所使用的較適合某類菌的經(jīng)驗(yàn)配方,再結(jié)合所用菌種和產(chǎn)品的特性,采用搖瓶、玻璃罐等小型發(fā)酵設(shè)備,按照定的實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)和實(shí)驗(yàn)方法選擇出較為適合的培養(yǎng)基。
般培養(yǎng)基設(shè)計(jì)要經(jīng)過以下幾個(gè)步驟:
,根據(jù)前人的經(jīng)驗(yàn)和培養(yǎng)要求,初步確定可能的培養(yǎng)基組分用量。
二,通過單因子實(shí)驗(yàn)終確定為適宜的培養(yǎng)基成分。
第三,當(dāng)確定培養(yǎng)基成分后,再以統(tǒng)計(jì)學(xué)方法確定各成分適的濃度。常用的實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)有均勻設(shè)計(jì)、正交試驗(yàn)設(shè)計(jì)、響應(yīng)面分析等。
適培養(yǎng)基的配制除了要考慮到目標(biāo)產(chǎn)物的產(chǎn)量外,還要考慮到培養(yǎng)基原料的轉(zhuǎn)化率。發(fā)酵過程中的轉(zhuǎn)化率包括理論轉(zhuǎn)化率和實(shí)際轉(zhuǎn)化率。理論轉(zhuǎn)化率是指理想狀態(tài)下根據(jù)微生物的代謝途徑進(jìn)行物料衡算所得出的轉(zhuǎn)化率的大小。實(shí)際轉(zhuǎn)化率是指實(shí)際發(fā)酵過程中轉(zhuǎn)化率的大小。實(shí)際轉(zhuǎn)化率往往由于原料利用不、副產(chǎn)物形成等原因比理論轉(zhuǎn)化率要低。
1.理論轉(zhuǎn)化率的計(jì)算
生化反應(yīng)的本質(zhì)也是化學(xué)反應(yīng),理論轉(zhuǎn)化率可以通過反應(yīng)方程式的物料衡算來計(jì)算。但是,生化反應(yīng)有其復(fù)雜性,要給出反應(yīng)物和產(chǎn)物之間的定量的總代謝反應(yīng)式,就需要對生物代謝過程的每步反應(yīng)進(jìn)行深入的研究,只有些代謝途徑比較清楚的產(chǎn)物,可以對其理論轉(zhuǎn)化率進(jìn)行計(jì)算。
2.實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)
由于發(fā)酵培養(yǎng)基成分眾多,且各因素常存在交互作用,很難建立理論模型,培養(yǎng)基的成分和濃度都是通過實(shí)驗(yàn)獲得的,因此培養(yǎng)基優(yōu)化工作量大且復(fù)雜。般先是通過單因子實(shí)驗(yàn)確定培養(yǎng)基的組分,然后通過多因子實(shí)驗(yàn)確定培養(yǎng)基各組分及其適宜的濃度。目前許多實(shí)驗(yàn)技術(shù)和方法都在發(fā)酵培養(yǎng)基優(yōu)化上得到應(yīng)用,如生物模型(biological mimicry)、單次試驗(yàn)(one at a time)、全因子法(ful factorial)、部分因子法(partial factorial)、plackettfBurman法等,但每種實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)都有它的優(yōu)點(diǎn)和缺點(diǎn),不可能只用種試驗(yàn)設(shè)計(jì)來完成所有的工作。
(1)單次單因子試驗(yàn)
實(shí)驗(yàn)室常用的優(yōu)化方法是單次單因子(one variable at a time)試驗(yàn)。這種方法是在假設(shè)因素間不存在交互作用的前提下,通過次改變個(gè)因素的水平而其他因素保持恒定水平,然后逐個(gè)因素進(jìn)行考察的優(yōu)化方法。但是由于考察的因素間經(jīng)常存在交互作用,使得該方法并非總能獲得佳的優(yōu)化條件。另外,當(dāng)考察的因素較多時(shí),需要太多的實(shí)驗(yàn)次數(shù)和較長的實(shí)驗(yàn)周期。因此,現(xiàn)在的培養(yǎng)基優(yōu)化實(shí)驗(yàn)中般不采用或不單采用這種方法,而采用多因子試驗(yàn)。
(2)多因子試驗(yàn)
1)正交試驗(yàn)
正交試驗(yàn)設(shè)計(jì)是研究多因素多水平的種設(shè)計(jì)方法。它是根據(jù)正交性從全面試驗(yàn)中挑選出部分有代表性的點(diǎn)進(jìn)行試驗(yàn),這些有代表性的點(diǎn)具備了“均勻分散、齊整可比"的特點(diǎn),通過合理的實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì),可以較快地取得實(shí)驗(yàn)結(jié)果。具體可以分為下面四步:,根據(jù)問題的要求和客觀的條件確定因子和水平,列出因子水平表;第二,根據(jù)因子和水平數(shù)選用合適的正交表,設(shè)計(jì)正交表頭,并安排實(shí)驗(yàn);第三,根據(jù)正交表給出的實(shí)驗(yàn)方案,進(jìn)行實(shí)驗(yàn);第四,對實(shí)驗(yàn)結(jié)果進(jìn)行分析,選出較優(yōu)的“試驗(yàn)"條件以及對結(jié)果有顯著影響的因子。正交試驗(yàn)設(shè)計(jì)可同時(shí)考慮幾種因素,尋找佳因素水平結(jié)合,但它不能在給出的整個(gè)區(qū)域上找到因素和響應(yīng)值之間的個(gè)明確的函數(shù)表達(dá)式(即回歸方程),從而無法找到整個(gè)區(qū)域上因素的佳組合和響應(yīng)面值的優(yōu)2)均勻設(shè)計(jì)
均勻設(shè)計(jì)是數(shù)學(xué)方開泰和元于1978年先提出來的。它是種只考慮試驗(yàn)點(diǎn)在試驗(yàn)范圍內(nèi)均勻散布的試驗(yàn)設(shè)計(jì)方法。由于均勻設(shè)計(jì)只考慮試驗(yàn)點(diǎn)的“均勻散布",而不考慮“整齊可比",因而可以大大減少實(shí)驗(yàn)次數(shù)。均勻設(shè)計(jì)按均勻設(shè)計(jì)表來安排試驗(yàn),均勻設(shè)計(jì)表在使用時(shí)值得注意的是表中各列的因素水平不能像正交表那樣任意改變次序,而只能按照原來的次序進(jìn)行平滑,即把原來的后個(gè)水平與個(gè)水平銜接起來,組成個(gè)封閉圈,然后從任處開始定為個(gè)水平,按圈的原方向和相反方向依次排出第二、第三個(gè)水平。均勻設(shè)計(jì)只考慮試驗(yàn)點(diǎn)在試驗(yàn)范圍內(nèi)均勻分布,因而可使所需試驗(yàn)次數(shù)大大減少。例如項(xiàng)5因素10水平的試驗(yàn),若用正交設(shè)計(jì)需要做102次試驗(yàn),而用均勻設(shè)計(jì)只需做10次,隨著水平數(shù)的增多,均勻設(shè)計(jì)的*性就愈加突出,這就大大減少了多因素多水平試驗(yàn)中的試驗(yàn)次數(shù)。
3)plackettlBurman法
plackett固Burman試驗(yàn)主要針對因子數(shù)較多,且未確定眾因子相對于響應(yīng)變量的顯著影響的試驗(yàn)設(shè)計(jì)方法。此方法主要是對每個(gè)因子取兩水平來進(jìn)行分析,通過比較各個(gè)因子兩水平的差異與整體的差異來確定因子的顯著性,避免在后期的優(yōu)化試驗(yàn)中由于因子數(shù)太多或部分因子不顯著而浪費(fèi)試驗(yàn)資源。理論上,plackett留Burman設(shè)計(jì)法可以達(dá)到99個(gè)因子僅做100次試驗(yàn),因此,它通常作為過程優(yōu)化的初步實(shí)驗(yàn),用于確定影響過程的重要因子。p.Castro報(bào)道用此法設(shè)計(jì)20種培養(yǎng)基,做24次試驗(yàn),把v干擾素的產(chǎn)量提高了45%。但該法的缺點(diǎn)是不能考察各因子的相互交互作用。
4)部分因子設(shè)計(jì)法
部分因子設(shè)計(jì)法與plackettlBurman設(shè)計(jì)法樣是種兩水平的實(shí)驗(yàn)優(yōu)化方法,能夠用比全因子法次數(shù)少得多的實(shí)驗(yàn),從大量影響因子中篩選出重要的因子。根據(jù)實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)擬合出次多項(xiàng)式,并以此利用陡爬坡法確定大響應(yīng)區(qū)域,以便利用響應(yīng)面法進(jìn)步優(yōu)化。
5)響應(yīng)面分析法
響應(yīng)面分析(response surface analysis,RSM)法是數(shù)學(xué)與統(tǒng)計(jì)學(xué)相結(jié)合的產(chǎn)物,和其他統(tǒng)計(jì)方法樣,由于采用了合理的實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì),能以經(jīng)濟(jì)的方式,用很少的實(shí)驗(yàn)數(shù)量和時(shí)間對實(shí)驗(yàn)進(jìn)行全面研究,科學(xué)地提供局部與整體的關(guān)系。其他試驗(yàn)設(shè)計(jì)與優(yōu)化方法未能給出直觀的圖形,因而也不能憑直覺觀察其優(yōu)化點(diǎn),雖然能找出優(yōu)值,但難以直觀地判別優(yōu)化區(qū)域。響應(yīng)面分析法以回歸方法作為函數(shù)估算的工具,將多因子實(shí)驗(yàn)中因子與實(shí)驗(yàn)結(jié)果(響應(yīng)值)的關(guān)系函數(shù)化,依此可對函數(shù)的面進(jìn)行分析,研究因子與響應(yīng)值之間、因子與因子之間的相互關(guān)系,并進(jìn)行優(yōu)化,運(yùn)用圖形技術(shù)將這種函數(shù)關(guān)系顯示出來,以供我們憑借直覺的觀察來選擇試驗(yàn)設(shè)計(jì)中的優(yōu)化條件。近年來較多的報(bào)道都是用響應(yīng)面分析法來優(yōu)化發(fā)酵培養(yǎng)基,并取得比較好的成果。
RSM有許多方面的優(yōu)點(diǎn),但它仍有定的局限性。先,如果將因素水平選得太寬,或選的關(guān)鍵因素不全,將會導(dǎo)致響應(yīng)面出現(xiàn)吊兜和鞍點(diǎn)。因此事先必須進(jìn)行調(diào)研、查詢和充分的論證,或者通過其他試驗(yàn)設(shè)計(jì)得出主要影響因子;其次,通過回歸分析得到的結(jié)果只能對該類實(shí)驗(yàn)做估計(jì);第三,當(dāng)回歸數(shù)據(jù)用于預(yù)測時(shí),只能在因素所限的范圍內(nèi)進(jìn)行預(yù)測。響應(yīng)面擬合方程只在考察的緊接區(qū)域里才接近真實(shí)情形,在其他區(qū)域里擬合方程與被近似的函數(shù)方程毫無相似之處,幾乎無意義。
中心組合設(shè)計(jì)是種際上較為常用的響應(yīng)面法,是種五水平的實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)法。采用該法能夠在有限的實(shí)驗(yàn)次數(shù)下對影響生物過程的因子及其交互作用進(jìn)行評價(jià),而且還能對各因子進(jìn)行優(yōu)化,以獲得影響過程的佳條件。